手机端单位车扣分处理的方法如下：
现场处理
违章驾驶人员需要携带公司车辆的行驶证、自己的驾驶证以及身份证，前往当地车管所的违章处理窗口进行办理。在那里，领取号码并排队等待处理。接下来，提交所需的相关资料，并签认处罚决定书。最后，在处罚决定书规定的十五天期限内，完成罚款的缴纳即可。
通过交管12123APP处理
首先下载并登录交管12123APP，登录账号为身份证号，密码通常是身份证后六位，也可以通过手机验证进行密码修改。
在APP主界面选择“违法处理”功能，初次使用需先绑定机动车，然后查询违章记录。
选择需要处理的违章记录后，点击“处理并缴款”按钮。
最后选择支付方式完成罚款支付即可。
公司内部处理
公司车辆违章，应该由违章时的实际驾驶人去处理，持驾驶证、行驶证到所在地的车辆违章中心处理即可。违章罚款是不允许报销的，所以驾驶员违章应该自行承担后果。
绑定多个驾驶证
如果公司车辆存在多次违章记录，可以考虑绑定多个驾驶证进行网上处理。但需注意，一辆车最多只能绑定三个驾驶证，而一个驾驶证最多也只能绑定三辆车。
缴纳罚款
违章罚款通常是个人承担的费用，因此驾驶员必须自行承担扣分带来的后果。然而，在极少数情况下，如公司领导强制要求违章行驶，而驾驶员无法阻止，导致的罚款可能需要由公司或相关领导承担部分责任。
建议
及时缴纳罚款：无论通过何种方式处理，驾驶员都需要在规定的期限内缴纳罚款，以免产生滞纳金或其他额外费用。
明确责任：公司应明确车辆违章的责任人，并在内部进行相应的管理和记录，以便在出现问题时能够及时找到责任人并妥善处理。
使用APP处理：推荐使用交管12123APP进行违章处理，方便快捷，可以随时随地进行查询和处理。
